Os reservatórios devem ser limpos, pelo menos, de 6 em 6 meses, para que as partículas em suspensão, não propiciem um meio de cultura para a proliferação de micro organismos. As micro-partículas vão se acumulando lentamente, formando uma camada de lodo que, para ser mineralizada, consome o cloro que entra diariamente no depósito, através da distribuição.

Os inúmeros organismos que vivem na água têm duas origens:
l Origem animal - Protozoários, micro crustáceos diversos, nematódeos (vermes   arredondados), quironomídeos (larvas de insetos), rotíferos, etc.
l Origem vegetal - Algas, bactérias e fungos.

É comum haver contaminação de cisterna e caixa d'água devido à ocorrência de enchentes ou ruptura de adutoras.

Em ambos os casos, a desinfecção do reservatório domiciliar deve ser imediata, bem como a verificação de danos aos referidos recipientes.

Além da higienização dos reservatórios, verificamos se há rachaduras, fendas, infiltrações, e se a tampa está bem vedada, evitando a entrada de poeira, insetos ou qualquer outro tipo de organismo que propicie a contaminação da água.